Cada nivel en el juego presenta nuevos incrementos de fuerza (como congelar, relámpago y multiarmas) y habilidades especiales del organismo (como campo de fuerza, regeneración y frenesí) para intensificar la acción a través de todo el juego. La versión completa de Dr. Blob's Organism presenta 20 desafiantes niveles, 10 incrementos de fuerza, 5 habilidades de mancha pasmante, 3 configuraciones de dificultad, 21 pistas originales de música, suavizados efectos de sonido, niveles de bono y una rocola!